Wojewódzki Urząd Pracy w Krakowie dzieli środki Krajowego Funduszu Szkoleniowego na powiatowe urzędy pracy w Małopolsce, koordynuje wydatkowanie Funduszu na terenie województwa i wspiera urzędy w realizacji zadań z tym związanych. Prowadzi działania promocyjno-informacyjne dotyczące KFS oraz bada wyniki pomocy udzielonej pracodawcom.
Może również ustalić do 31 października każdego roku listę obejmującą nie więcej niż trzy priorytety wydatkowania KFS na kolejny rok, właściwe dla danego województwa, po zasięgnięciu opinii Wojewódzkiej Rady Rynku Pracy.